万年寺的历史悠久，高僧辈出，佛教文物十分丰富。1961年3月4日，国务院公布“峨眉山圣寿万年寺铜铁佛像”为第一批全国重点文物保护单位。1956年8月16日，经四川省人民委员会批准公布，无梁砖殿为四川省重点文物保护单位。寺内的珍藏文物十分丰富，品位极高。如佛像、“佛门三宝”（贝叶经、佛牙、御印）、法器、书画、匾对、寺院建筑、寺院装饰等等。
万年寺的寺院布局十分精美，整座寺院坐西朝东，依次为山门、观音殿（弥勒殿）、般若堂、毗卢殿、砖殿（普贤殿）、三宝楼（行愿楼）、贝叶楼、巍峨宝殿和大雄宝殿。山门、般若堂、观音殿（弥勒殿）、三宝楼、贝叶楼为20世纪八、九十年代新建。以山门、观音殿（弥勒殿）、毗卢殿、般若堂为前庭，砖殿、三宝楼（行愿楼）、贝叶楼为中部，巍峨宝殿、大雄宝殿及两厢为后部，前后呼应，三点相连，承上启下。巍峨宝殿和大雄宝殿并厢房组成四合院，四面回廊，宽敞舒适。全寺除砖殿为砖石穹隆顶外，其余均为木结构，穿逗式梁架，重檐歇山顶，小青瓦屋面，座5级平台，前后高差近5米。寺内园林颇有特色，物种丰富，珍品很多。
